L’Assemblea degli Associati, il Consiglio Direttivo, il Presidente, le Commissioni,  il Comitato Tecnico Scientifico: questi gli organi di Anpaca, supportati dall’operatività del Segretario Generale. I membri del Consiglio Direttivo di Anpaca, eletti tra gli aderenti, rappresentano i Soggetti Responsabili di Patti Territoriali già finanziati, i Responsabili Unici di Contratti d’Area già finanziati, le Società di gestione di strumenti di programmazione negoziata e Province e Comuni, associati ad Anpaca. Il rispetto della territorialità e della tipologia dello strumento di programmazione nonché la rappresentatività di settore, sono altri elementi alla base della partecipazione al Consiglio Direttivo dell’Associazione. Vengono rappresentati in Anpaca anche i Patti Territoriali ed i Contratti d’Area non ancora approvati.